Durant cette période 35 000 juifs arrivèrent dans le pays. La montée en Israël des juifs du Maroc ne s'arrêta pas en 1956, elle continua par la suite mais de façon illégale après l'indépendance du Maroc. Entre les années 1956 et 1961 arrivèrent en Israël de façon secrète 30 000 juifs. L'incident le plus tragique de cette période reste sans conteste, l'accident du bateau "Egoz" (noisette) qui sombra en emportant 43 passagers et un agent israélien du "mossad" Haïm Tsarfati ,dans la nuit du 10 au 11 janvier 1961. Cet accident mis en évidence cette alya qui restait secrète, suite à la pression internationale, le Maroc donna l'autorisation aux juifs de quitter le pays. Pendant la période allant de 1961 à 1964 le Roi Hassan II du Maroc "ferma les yeux" sur cette alya.. Durant ces années arrivèrent en Israël 80 000 juifs du Maroc.
Au total, et depuis la création de l'Etat près d'un quart de million de juifs arrivèrent du Maroc, c'est l'alya la plus importante d'un pays musulman.